Nebenwirkungen sind nicht ausgeschlossen. Unter einer Misteltherapie sind jedoch bei bestimmungsgemässem Gebrauch selten nennenswerte unerwünschte Wirkungen beobachtet worden. Bei zu hoher Dosierung sind sogenannte überschiessende Lokalreaktionen mit mehr als 5 cm Durchmesser möglich. In diesem Fall sollte die Behandlung in Absprache mit der zuständigen Fachperson erst nach Abklingen der Symptome und in reduzierter Dosis (nächstniedrigere Konzentration) fortgeführt werden. Das Gleiche gilt für starke Allgemeinreaktionen wie einer Erhöhung der Körpertemperatur auf über 38°C. Auch hier ist eine Abklärung durch die behandelnde Fachperson angezeigt.